チッソ株式会社は、本社を東京におき水俣工場のほか千葉県や岡山県に工場を持っています。チッソ水俣工場の主な製品は、液晶、保存料、保湿材、化学肥料、合成樹脂などです。従業員は約６６０人（２０００年９月現在）を数え、今でも水俣では主要な企業です。
チッソは水俣病の原因企業として大きな賠償責任を負っています。１９７５年（昭和５０）以降経営が悪化し患者などへの補償金の支払いができなくなるおそれが出てきたため、１９７８年（昭和５３）から国や熊本県は県債発行を通して金融支援を行ってきました。発行された県債の総額は２０００年（平成１２）３月末現在、約２，５６８億円にのぼり、そのうち約１，６１１億円を今後、チッソは県に返済することになっています。